Case
项目案例
“三千亿级多样性”抗体库的构建(AI辅助设计)
背景:
利用噬菌体展示技术构建的天然全人源抗体库有着多样性低(107 ~ 108)的固有缺点,因而降低了其抗体的筛选成功率。而全合成库技术的出现则克服了这种缺点,全合成库技术以已有的抗体为模板,在抗体的互补决定区(complementarity-determining regions,CDR)进行高通量的突变,所获得的突变Fab/scFv/VHH噬菌体小库多样性可达到1010。由ABLINK所开发的‘三千亿级多样性’抗体库包含了多个全合成抗体大库,每个大库包含了二十至八十个小库。
流程:
全合成人源化Fab抗体库
1. 选择表达好、亲和力高的抗体单克隆为模板。
2. 基因全合成pelB-VL-CH1和pelB-VH-CH1的串联DNA,克隆到噬菌粒。
3. 利用Kunkel法对VL和VH 的CDR区域进行高通量突变,构建突变Fab DNA文库。
4. 将DNA文库电转入超级感受态细胞(含helper phage)中,构建突变Fab噬菌体库亚库。
5. 将多个亚库混合形成全合成人源化Fab抗体库。
全合成人scFv抗体库
1. PCR扩增人抗体胚系基因DP47H和DPK22、DPL11,克隆到普通载体上。
2. 使用IUB code简并引物PCR突变CDR区域,overlap PCR构建DP47H-linker-DPK22和DP47H-linker-DPL11 scFv,克隆到噬菌粒上,构建突变scFv DNA文库。
3. 将DNA文库电转入感受态细胞(含helper phage)中,构建突变scFv噬菌体库亚库。
4. 将多个亚库混合形成全合全合成人scFv抗体库。
服务特色及优势:
1. 针对突变方法的优化、电转条件的优化和感受态细胞的改造而带来的多点位100%突变效率和实现单次电转1011的克隆。
2. 在突变引物设计上的丰富经验和AI的辅助带来的效率上的提升。