抗原结构分析和制备和表达（AI结构预测）

背景：

随着抗体库构建技术的发展与成熟，由ABLINK构建的高库容、高多样性抗体库已经不再成为限制筛选出先导抗体分子的影响因素。而对于抗原的结构分析则成为了目前主要的限制因素，影响着免疫抗体库的构建与高亲和力抗体的筛选。为此，ABLINK提供由AI辅助的抗原结构预测与分析服务及原核和哺乳动物细胞两套抗原蛋白表达系统，以满足客户不同需求；同时仅要求客户提供DNA或氨基酸序列，降低客户负担。

流程：

抗原结构分析——以Claudin 18.2 靶点为例

靶点Claudin 18.2为有四次跨膜的蛋白，有两段较大的胞外区，与蛋白Claudin 18.1 的氨基酸差异点位较少，使得纳米抗体筛选变得困难。同时在对18.2的结构分析中通过寻找公开结构信息，发现无已知结构，故选取同家族多个已知结构建立同源模型分析；评估同源模型可靠性：一级序列同源度>50%，三个独立模型的二级结构骨架相似。之后使用同源度最高模型，分析潜在的抗原表位：下图示蓝绿色和灰绿色分别为胞外区1和2，两个区域各有独立的序列标位部分，且共同构成空间表位；紫红色为人和骆驼的氨基酸位点差异，主要分布于胞外区1，故从羊驼免疫的角度，选择最优免疫策略为保留跨膜框架（白色）及全部胞外区的蛋白/过表达细胞株，次优主要保留胞外区1。